رئیس دفتر آیت‌الله بطحایی گلپایگانی از نامزد شدن این عضو مجلس خبرگان رهبری در انتخابات دوازدهمین دوره ریاست‌جمهوری خبر داد.
به گزارش ایران‌جیب به نقل از ایرنا، نام نویسی از داوطلبان انتخابات دوازدهمین دوره ریاست جمهوری از 22 فروردین ماه 1396 آغاز می شود و این انتخابات همزمان با انتخابات پنجمین دوره شوراهای اسلامی شهر و روستا در 29 اردیبهشت 96 برگزار می شود.
سید هاشم بطحایی از اساتید دانشگاه تهران بود که با روی کار آمدن دولت محمود احمدی‌نژاد مانند بسیاری از سایر اساتید دانشگاهی مخالف سیاست‌های او بازنشسته شد. او پس از بازنشستگی در نامه‌ای خطاب به احمدی‌نژاد ضمن تأکید بر این که بادآورده نیست. از یک طرف از سوابق علمی خود گفته و از طرف دیگر هم تشریح کرده بود که او را بر اساس اغراض داخلی بازنشسته کرده‌اند.